文献类型: 中文期刊
作者: 杨冬静 1 ; 马居奎 1 ; 唐伟 1 ; 陈晶伟 1 ; 高方园 1 ; 张成玲 1 ; 孙厚俊 1 ; 谢逸萍 1 ;
作者机构: 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业农村部 甘薯生物学与遗传育种重点实验室
关键词: 甘薯;长喙壳菌;侵染;转录组测序;抗病基因;调控机理
期刊名称: 江西农业学报
ISSN: 1001-8581
年卷期: 2022 年 34 卷 007 期
页码: 60-69
摘要: 以不侵染黑斑病菌长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)的抗病甘薯品种南京92和感病品种徐薯18的薯块为对照组,以侵染时间1、3、7 d时的薯块为处理组进行转录组测序.测序结果表明:在抗病品种中找到36127个差异表达基因(differential expressed genes,DEGs),其中上调、下调表达的基因分别有17387、18740个;在感病品种中找到44663个DEGs,其中上调、下调表达的基因分别有22928、21735个;在相同时间点抗、感品种间的R1 vs S1、R2 vs S2、R3 vs S3和R4 vs S4这4个对比组中有1057个共有DEGs.GO富集分析结果表明:甘薯长喙壳菌侵染3 d时抗、感品种中富集到的前20的GO条目均主要为细胞成分,其次为生物过程和分子调控;隶属于生物过程的单一生物代谢过程、隶属于分子功能的氧化还原酶活性和四吡咯结合,以及隶属于细胞组分的质体和细胞外围等条目在抗、感品种中均被富集到.KEGG通路富集分析结果表明:在富集的前20的KEGG信号通路中,抗、感品种中的差异基因主要被富集到代谢途径、次级代谢产物的生物合成、碳代谢、苯丙烷生物合成、柠檬酸循环/三羧酸循环以及光合作用等通路上.此外,对长喙壳菌侵染甘薯块根的抗性相关基因进行了分析,共鉴定出221个抗性相关基因,其中激酶类(kinase,KIN)基因最多,有117个,占比为52.9%.
- 相关文献
[1]甘薯脱毒种薯连年使用后的病毒侵染情况及产量变化. 邢继英,孙爱根,胡兰英,杨永嘉. 1999
[2]基于RNA-seq的甘薯芽变株系类胡萝卜素基因代谢差异分析. 赵冬兰,赵凌霄,刘洋,张安,戴习彬,周志林,曹清河. 2023
[3]水稻生育后期外源赤霉素调控稻草饲用品质的机理研究. 董臣飞,顾洪如,丁成龙,许能祥,张文洁. 2016
[4]小豆种质资源对大豆花叶病毒病抗性的初步研究. 陈新,崔晓艳,袁星星,万建民,翟虎渠. 2015
[5]稻曲病菌致病机制研究进展. 俞咪娜,黄世文,刘永锋. 2019
[6]蛇床子素对南瓜白粉病菌侵染的影响. 李彩霞,周威,纪明山,石志琦. 2007
[7]水稻白叶枯病菌对体细胞突变体HX-3愈伤组织的侵染. 高东迎,孙立华,刘蔼民. 2004
[8]大麦白化颖壳突变体的转录组学分析. 栾海业,臧慧,沈会权,张英虎,乔海龙,陶红,申玉香,陈和. 2017
[9]转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因. 付言峰,李兰,赵为民,方晓敏,李碧侠,王学敏,周李生,任守文. 2018
[10]转录组测序分析毒死蜱与醚菊酯混配对二化螟毒杀的增效机制. 徐鹿,罗光华,金瑜剑,徐德进,徐广春,顾中言. 2021
[11]魏可葡萄气生根发育的转录组分析. 葛金涛,王江英,赵文静,邵小斌,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,刘兴满. 2020
[12]低氮处理对玉米早期发育胚乳中氨基酸水平和转录组的影响. 潘玉昕,赵涵,宁丽华. 2024
[13]不同蛋白含量大豆籽粒的转录组分析及蛋白合成相关基因预测. 张黎杰,刘书华,周玲玲. 2022
[14]嫁接砧木对西瓜枯萎病的抗病机理研究(摘要). 张曼,羊杏平,徐锦华,刘广,姚协丰,李苹芳. 2014
[15]斑点叉尾鮰伪雌鱼卵巢发育评估及比较转录组研究. 徐思琪,张世勇,王明华,刘洪岩,钟立强,陈校辉. 2024
[16]MSTN基因编辑湖羊胫腓肌的转录组分析. 李隐侠,刘伟佳,张晨俭,舒嘉傲,桂红兵,王慧利,孟春花,张俊,张建丽,钱勇,曹少先. 2024
[17]基因差异表达分析方法及其在作物遗传育种中的应用. 苏在兴,高闰飞,李强. 2017
[18]梅山猪胚胎附植期EphB2的组织表达及RNA-seq分析. 付言峰,周艳红,王爱国,李兰,刘红林,李碧侠,任守文. 2014
[19]热应激前后湖羊下丘脑差异表达新基因的筛选与注释. 李隐侠,冯小品,张莉,张俊,钱勇,孟春花,王慧利,仲跻峰,曹少先. 2019
[20]紫肉甘薯及其突变体花青素积累差异的比较转录组分析. 后猛,李臣,宋炜涵,张允刚,李强. 2022
作者其他论文 更多>>
-
植物生长调节剂复配对甘薯薯苗生长及产量的影响
作者:陈晶伟;马居奎;高方园;张成玲;杨冬静;唐伟;谢逸萍;孙厚俊
关键词:植物生长调节剂;二氢卟吩铁可溶性粉剂;甘薯;产量;品质
-
甘薯黑斑病菌Cel61A基因克隆与表达分析
作者:罗勤川;孙厚俊;唐伟;谢逸萍;杨冬静;马居奎;陈晶伟;高方园;张成玲
关键词:甘薯长喙壳菌;多糖单加氧酶;生物信息学;克隆;基因表达
-
腐皮镰刀菌侵染甘薯的转录组分析
作者:罗勤川;唐伟;马居奎;陈晶伟;杨冬静;高方园;孙厚俊;谢逸萍;张成玲
关键词:腐皮镰刀菌;甘薯;转录组
-
美人蕉黄条病毒扬州、长沙分离物全基因组的测定与序列分析
作者:朱晨;唐伟;阴筱;董玲霞;孙厚俊
关键词:美人蕉;美人蕉黄条病毒;全基因组测定;系统进化分析
-
甘薯茎线虫病抗扩展性遗传特性分析与QTL定位
作者:闫会;张成玲;张允刚;马居奎;马猛;孙厚俊;李强
关键词:甘薯茎线虫病;F1群体;遗传力;QTL定位;候选基因注释
-
我国甘薯E病毒全基因组序列特征及荧光定量检测技术的建立
作者:唐伟;张成玲;杨冬静;马居奎;陈晶伟;高方园;谢逸萍;孙厚俊
关键词:甘薯;甘薯E病毒;全基因组;系统进化分析;qPCR检测
-
我国甘薯主要病虫害与防治措施概述
作者:贺娟;刘万才;赵中华;孙厚俊
关键词:甘薯;主要病虫害;防治