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谷子SiWRKY03基因的分子特征与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 宋振君 1 ; 李志勇 1 ; 王永芳 1 ; 刘磊 1 ; 白辉 1 ; 董志平 1 ;

作者机构: 1.河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮重点实验室;河北师范大学生命科学学院

关键词: 谷子;谷子锈病;WRKY转录因子;基因表达;抗病反应

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 20-25

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: WRKY是参与植物生长发育与抗逆反应的一类转录因子。为了解谷子中SiWRKY03基因的功能,利用生物信息学软件分析了其生物学特征,采用Real-time PCR技术检测了SiWRKY03转录因子在谷子不同组织部位和抗谷锈病过程中的表达丰度变化。结果表明,SiWRKY03基因的开放阅读框全长为1 137 bp,编码378个氨基酸,预测分子质量为39.73 ku,理论等电点(pI)为5.91,含有1个WRKY保守结构域。该蛋白质二级结构的最大元件是无规则卷曲,最小元件为β-转角。进化分析表明,SiWRKY03与糜子(RLM93064.1)和哈氏黍(PAN29607.1)的氨基酸序列同源性最高,为99%。组织表达分析表明,该基因在谷子根、茎、叶和穗中均有表达,其中根中表达量最高,穗中表达量最低,与转录组数据一致。在谷子响应锈菌胁迫反应的120 h内,SiWRKY03基因在抗病反应的12,36 h上调表达,而感病反应过程中无显著性变化,推测SiWRKY03在谷子抗锈病反应中起正调控作用。上述试验结果为进一步研究SiWRKY03基因功能与抗病机制奠定理论基础。

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