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短短芽胞杆菌代谢物组测定中代谢终止方式的优化

文献类型： 中文期刊

作者： 陈梅春 1 ; 刘波 1 ; 朱育菁 1 ; 陈峥 1 ; 史怀 1 ; 刘国红 1 ; 潘志针 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院农业生物资源研究所

关键词： 短短芽胞杆菌;代谢组学;灭活;胞内代谢物;正负离子模式

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2012 年 27 卷 12 期

页码： 1352-1359

摘要： 微生物代谢组学是定性和定量研究分析细胞内外所有低分子量代谢产物,在发酵控制分析、代谢物控制分析及其他组学联用进行菌种改良等方面得到了应用。胞内代谢物种类和浓度变化非常迅速,因此快速冻结代谢反应是非常重要的,所以必须有效率高和可靠的代谢终止方式,减少代谢物的流失。本研究以短短芽胞杆菌JK-2为研究对象,以LC-MS测定为评价标准,考察了5种代谢终止方式对胞内代谢物保留程度。结果表明,冷甲醇/水(含HEPES)代谢终止方式能够保留的代谢物最多,效率最高及其重现性好,在LC-MS正离子模式下,能够提取出3 000多种胞内代谢物。同时也考察了样品在正负模式下测试情况,结果表明正离子模式下能够检测到的代谢物的数目远远超过负离子模式下检测的数目。

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