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点滴复膜酵母兔源分离株基因组测序及比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙洪超 1 ; 付媛 1 ; 缪伟 2 ; 石团员 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所

2.中国科学院水生生物研究所

关键词： 点滴复膜酵母;基因组测序;全基因组复制

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2022 年 41 卷 002 期

页码： 237-247

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 点滴复膜酵母Cyniclomyces guttulatu是一种定殖及生长于犬、兔、豚鼠、龙猫、大鼠和小鼠等动物胃肠道内的真菌.与大多数传统酵母相比,点滴复膜酵母具有耐酸(pH 1.5-4.5)、耐高温(38-42℃)的独特生长特性,可在体外快速增殖.腹泻动物粪便中可见大量点滴复膜酵母,尽管没有直接证据表明感染点滴复膜酵母会引起明显病状,但其被认为是多种动物的机会性致病菌.本研究通过全基因组测序和转录组测序明确点滴复膜酵母的基因结构和注释信息,获得点滴复膜酵母的系统性基因组和转录组数据.结果 显示基因组大小为29.71 Mb,包含11307个基因,转录组大小为17.67 Mb,GC含量分别为43.02%和43.09%;mRNA、CDS、外显子和内含子的平均长度分别为1476、1447、1374和540bp;点滴复膜酵母存在517个独特的基因家族,共包括1162个基因,该酵母的独特基因特点为后续研究奠定基础.比较分析结果表明,点滴复膜酵母的基因组大小和数量明显大于其他12种酵母,提示该酵母可能存在全基因组复制,这可能与其独特的胃肠道定殖、耐酸和耐高温生长特性密切相关.

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