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2016年江苏省类猪圆环病毒P1分子流行病学回顾性调查

文献类型: 中文期刊

作者: 盛少阳 1 ; 温立斌 1 ; 茅爱华 1 ; 朱雪姣 1 ; 李彬 1 ; 任子利 1 ; 何孔旺 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院兽医研究所;西藏农牧学院动物科技学院

关键词: 类猪圆环病毒P1;序列分析;江苏

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2019 年 03 期

页码: 97-100

收录情况: 北大核心

摘要: 旨在了解2016年江苏省类猪圆环病毒P1流行及毒株变异情况。运用PCR技术对江苏省9个县级市送检的330份血清进行检测,并进行全基因组测序,应用BioEdit和DNAStar对获得的P1全长基因组及ORF1与GenBank中的参考毒株进行序列比对及同源性分析,并进行系统进化树分析。共检出阳性样品43份,占总样品数的13%;9个地级市P1检出率差异显著,其中,沛县检出率最高为38.2%,其余各地0%~20%不等。选取9个县级市的代表毒株进行全基因组测序,共获得12株P1全长序列,12株毒株核苷酸同源性在99.4%~100%,ORF1核苷酸同源性在99.1%~100%;与参考毒株相比,ORF1核苷酸同源性在99.4%~100%,氨基酸同源性在99.1%~100%。研究表明,2016年江苏省各地区P1感染率差异显著,但整体感染率较高,毒株变异较小。

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