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基于线粒体D-loop区和Cyt b基因分析广西禾花鲤三个群体遗传结构

文献类型: 中文期刊

作者: 程磊 1 ; 何苹萍 2 ; 韦嫔媛 2 ; 鲁翠云 1 ; 吴铁军 2 ; 彭金霞 2 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所农业农村部水产生物技术与遗传育种重点实验室

2.广西水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室

关键词: 禾花鲤;遗传结构;线粒体DNA;渐渗

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2021 年 45 卷 001 期

页码: 54-59

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究基于线粒体D-loop区和Cyt b基因部分序列,分析了广西全州、融水、环江三地禾花鲤(Cyprinus carpio)的遗传结构.在3个群体中共鉴定到19种D-loop与Cyt b序列的组合单倍型,总的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.916±0.010和0.008±0.004,禾花鲤线粒体DNA具有单倍型多样性高和核苷酸多样性低的特点.环江群体单倍型多样性最低,但是核苷酸多样性却最高,反映了环江群体存在最明显的谱系混杂.分子方差分析(AMOVA)显示遗传变异主要来源于群体内部(71.54%),禾花鲤三个群体间有显著的遗传分化(Fst=0.285;P<0.01).系统发育分析表明,多数样本的线粒体单倍型属于华南鲤(C.carpio rubrefusus)类型,同时三地禾花鲤中均检测到一定频率的西鲤(C.carpio carpio)或远东鲤(C.carpio haematopterus)类型的线粒体单倍型,提示禾花鲤可能受到鲤养殖品种的杂交渐渗.研究初步揭示了广西禾花鲤的种质资源现状,为禾花鲤这一地方特色"稻鱼共作"品种的选育和苗种管理提供了必要的依据.

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