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滩羊和湖羊背最长肌全基因组甲基化差异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 岳彩娟 1 ; 梁小军 1 ; 王秀琴 1 ; 马青 1 ; 马吉锋 1 ; 张俊丽 1 ; 王晓薇 1 ; 额尔和花 1 ;

作者机构： 1.宁夏农林科学院动物科学研究所

关键词： 绵羊;背最长肌;全基因组;甲基化

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2020 年 010 期

页码： 3058-3068

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在通过不同品种绵羊背最长肌的全基因组甲基化差异分析,鉴定差异甲基化区域(DMR)和差异甲基化基因(DMG),为解析绵羊骨骼肌发育差异奠定基础.采用全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术开展了周岁龄滩羊、湖羊和滩湖F2代背最长肌全基因组DNA的甲基化水平检测和差异甲基化区域分析,探讨品种间DNA甲基化水平的差异.结果显示,全基因组范围内滩羊、湖羊和滩湖F2代胞嘧啶(C)甲基化(mC)率分别为3.55%、3.18%和3.56%,3个群体的甲基化水平基本一致.对滩羊和湖羊的甲基化水平进行比较,在不同序列环境下共检测到97 731个DMRs和10 784个DMGs.在CG、CHH、CHG序列环境下3个群体甲基化水平无显著差异.对DMGs通过基因本体(GO)和相关信号通路(KEGG)分析,共检测到419个GO条目和20个信号通路,显著富集在细胞过程、细胞组分、结合、长期抑制等相关条目中.筛选出5个与肌肉调控有关的候选基因ACTA2、ROCK1、CALD1、MYH3、MYH10.本研究绘制了滩羊、湖羊和滩湖F2代全基因组甲基化图谱,为表观遗传调控肌肉发育研究和肉质候选基因的筛选提供理论参考.

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