您好,欢迎访问河南省农业科学院 机构知识库!

甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王丽 1 ; 王振东 1 ; 乔奇 2 ; 秦艳红 2 ; 张德胜 2 ; 田雨婷 2 ; 王爽 2 ; 张立军 1 ; 张振臣 2 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学农学院

2.河南省农业科学院植物保护研究所

关键词: 甘薯褪绿矮化病毒西非株系;荧光探针;实时荧光定量PCR

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2014 年 44 卷 05 期

页码: 461-468

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 依据Gen Bank中登录的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)西非株系(WA)的核苷酸序列,分别设计两对特异性引物和一条Taq Man探针。以SPCSV-WA外壳蛋白(cp)基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法。试验结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568%。最低可检测到约3.31 copies/μL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1 000倍。本研究建立的SPCSV实时荧光定量PCR方法可用于田间样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段。

  • 相关文献

[1]甘薯褪绿矮化病毒西非株系RT-RPA-LFD检测方法的建立与应用. 王永江,乔奇,王爽,赵付枚,田雨婷,张德胜,张振臣. 2024

[2]甘薯褪绿矮化病毒西非株系RT-LAMP检测方法的建立. 乔奇,张振臣,秦艳红,张德胜,田雨婷,王爽,王永江. 2013

[3]一种高效检测铜离子的罗丹明类荧光探针的构建及应用. 贾斌,李漫,郑嘉,郭洁,王铁良,王允,刘冬梅,张迪,刘继红. 2021

[4]一种新型比率型次氯酸根荧光探针的合成及性能研究. 李漫,郭洁,冯新颖,周晓华,张迪,付博,王铁良. 2021

[5]荧光探针PCR检测牛嵴病毒的方法建立. 师志海,王文佳,孟红丽,王亚州,闫祥洲,邱祥琦,程燕,滑留帅,施巧婷,徐照学. 2022

[6]用于亚硒酸钠检测的近红外荧光探针的设计合成及其应用研究. 张迪,李漫,郭洁,马志伟,魏亮亮,王铁良,刘继红. 2021

[7]甘薯羽状斑驳病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立. 王丽,王振东,乔奇,秦艳红,张德胜,田雨婷,王爽,张立军,张振臣. 2013

[8]基于氮掺杂碳量子点的荧光微球制备和Fe~(3+)检测. 刘清浩,何艳飞,梁丽娜,念继鹏,胡志勇,郭金春,梁栋,刘红彦. 2018

[9]蓝舌病病毒实时荧光RT—PCR检测技术. 尹惠琼,张红,史利军,杨姝,张改平,王升启,章金刚. 2012

[10]二化螟鞘磷脂合酶相关基因CsSMSr的克隆、真核表达及表达谱分析. 郑作林,周瀛,杨琼,巩中军,程家安,祝增荣. 2013

[11]甘蔗花叶病毒侵染玉米后硫氧还蛋白M1,M3的表达谱变化. 施艳,孙虎,孙炳剑,王振跃. 2012

[12]甘薯双生病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 田雨婷,赵晓立,乔奇,王爽,秦艳红,张德胜,王永江,张振臣. 2019

[13]牛星状病毒EvaGreen实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 师志海,王文佳,张彬,孟红丽,王亚州,金磊,兰亚莉,徐照学. 2021

[14]牛诺如病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 师志海,王文佳,兰亚莉,张彬,孟红丽,王亚州,滑留帅,徐照学. 2020

[15]猪圆环病毒3型TB GreenⅡ实时荧光定量PCR检测方法的建立和应用. 李鹏,孙延举,王寅彪,金前跃,梁晓晓,银梅,王选年,刘兴友,王利平. 2023

[16]基于病菌孢子捕捉和real-time PCR技术的田间空气中小麦白粉病菌孢子动态监测及病情估计模型研究. 王奥霖,商昭月,张美惠,王贵,胡小平,徐飞,孙振宇,曹世勤,刘伟,范洁茹,周益林. 2024

[17]我国十省份羊巴贝斯虫的分子流行病学调查. 杨强,刘爱红,刘军龙,杨吉飞,李有全. 2016

[18]马立克病病毒超强毒株GX0101感染宿主部分病毒基因表达水平及致病阶段分析. 马圣明,滕蔓,余祖华,党露,李会珍,丁轲,邓瑞广,罗俊. 2016

[19]小檗碱对金黄色葡萄球菌生物被膜的抑制作用. 师志海,王亚州,谢楠,王文佳. 2023

[20]猪IFN-β和IRF-3基因实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立. 王蕊,张改平,乔松林,刘永晖,蒋志政,万博,鲍登克,王爱萍. 2012

作者其他论文 更多>>