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猪EEPD1基因变异筛选鉴定及其对猪肌内脂肪含量性状的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 吴俊静 1 ; 陈南琦 1 ; 刘晓哲 1 ; 乔木 1 ; 周佳伟 1 ; 彭先文 1 ; 梅书棋 1 ;

作者机构: 1.动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室

关键词: 猪;肌内脂肪含量;EEPD1基因;突变;关联分析

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2022 年 58 卷 008 期

页码: 147-152

收录情况: 北大核心

摘要: 随着社会经济发展与人民生活水平的不断提升,猪肉品质越来越受消费者重视.肌内脂肪(IMF)含量性状是影响猪肉品质的一个关键性指标.本研究发现猪EEPD1基因在肌内脂肪高低组硒都黑猪个体背最长肌组织中差异表达,并进一步利用混合DNA样本池PCR测序法在硒都黑猪群体中筛选鉴定出猪EEPD1基因g.123857 C>G、g.123907 A>G、g.124024 A>G、g.124050 G>A、g.124222 A>G等5个SNP变异位点.经关联分析后发现这5个SNP位点均显著影响IMF性状.其中g.123907 A>G、g.124024 A>G和g.124050 G>A 3个位点紧密连锁,所组成的单倍型也与IMF性状显著相关.生物信息学分析还发现,这5个SNP位点虽然不显著影响EEPD1蛋白结构,但是会导致其mRNA二级结构及稳定性发生变化,推测它们主要通过影响EEPD1蛋白翻译效率进而影响IMF性状.综上,本研究新发现了5个猪肉质性状的分子育种标记,为实现猪肉质性状的快速改良充实基础.

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