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龙眼体胚发生相关未知蛋白DlUP-3基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赖呈纯 1 ; 赖钟雄 1 ; 林玉玲 1 ;

作者机构： 1.福建农林大学园艺植物生物工程研究所

关键词： 龙眼;体胚发生;未知蛋白DlUP-3;基因克隆;定量表达

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2014 年 34 卷 02 期

页码： 237-242

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 在龙眼体胚发生早期的蛋白质组学研究中,发现1个体胚发生相关未知蛋白DlUP-3,通过简并引物结合RACE技术进行其基因全长序列克隆。结果显示:(1)克隆到的龙眼体胚发生相关未知蛋白基因DlUP-3的全长cDNA序列为1 681bp,开放阅读框由1 017个核苷酸组成,编码338个氨基酸(GenBank登录号为GQ167202)。(2)生物信息学分析发现,该基因推导蛋白分子量为36 854.2Da,pI为9.05;该蛋白为Ras蛋白质家族成员,具有ATP/GTP-binding site motif A(P-loop)结合位点和1个典型的Ras_like_GTPase superfamily组件,无典型信号肽结构,但有跨膜螺旋的亲水性蛋白;不规则卷曲是其最大量的结构元件,散布于整个蛋白质中。(3)实时荧光定量PCR分析显示,该基因在龙眼体胚发生过程中均有表达,其中以胚性愈伤组织阶段表达量最低,而球形胚阶段最高。研究表明,DlUP-3基因在龙眼体胚发生过程尤其是球形胚阶段有重要的作用,为进一步研究该基因在龙眼体胚发生过程中的功能奠定了基础。

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