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栝楼实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证

文献类型： 中文期刊

作者： 束红梅 1 ; 徐筋燕 1 ; 何晓兰 1 ; 郭书巧 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所

关键词： 栝楼;荧光定量PCR;内参基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 015 期

页码： 4975-4983

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 栝楼是葫芦科栝楼属雌雄异株植物,为了解雌雄株差异基因表达水平,需要筛选稳定表达的内参基因.本研究根据3个栝楼品种苗期雌雄株叶片的转录组测序结果,筛选出12个候选内参基因.通过荧光定量PCR(RT-qPCR)检测内参基因的表达量,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件评价候选内参基因的稳定性.结果显示,12个候选内参基因的表达量在所有样本间的变化幅度存在差异,综合分析3个评估软件结果得到Actin和GAPDH基因在所有样品中的表达最为稳定.栝楼雌、雄株部分差异基因的RT-qPCR分析结果与转录组结果相吻合,说明Actin和GAPDH基因适合作为栝楼基因表达研究的内参基因.本研究筛选出的最稳定的内参基因将为栝楼后续的基因表达研究提供校准依据.

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