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香蕉NPR1基因家族的鉴定及在枯萎病菌胁迫下表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 任陪娣 1 ; 谢碧玉 2 ; 陈翠 2 ; 贾彩红 2 ; 王静毅 2 ; 张建斌 2 ; 徐碧玉 2 ; 王卓 2 ; 金志强 2 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带生物技术重点开放实验室

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关键词: 香蕉;NPR1;生物信息学分析;香蕉枯萎病;表达分析

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2019 年 006 期

页码: 1621-1629

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析.共鉴定得到15个成员,将其命名为MaNPR1~MaNPR15.理化性质、保守功能结构域、重要的氨基酸残基及motif分析结果与其他物种所报道的有较高的一致度.香蕉NPR1基因家族成员种内进化树、基因结构及结构域的分类情况呈现出高度一致,表明了香蕉NPR1基因家族成员间有着明确的分工.种间进化树显示香蕉的NPR1基因分为3个分组,每个分组都含有拟南芥NPR1成员.主栽品种巴西蕉(Musa acuminata Colla. AAA group′Brazilian′)易感香蕉枯萎病,从巴西蕉CK及巴西蕉受枯萎病侵染2 d的根系转录组数据中综合表达量及表达趋势选定8个成员,并在巴西蕉与抗(耐)Foc TR4品种GCTCV-119中验证其表达模式.基因MaNPR4及MaNPR11在抗感品种中表现出明显的差异表达,在抗病品种GCTCV-119中随着Foc TR4侵染时间延长表达量不断增加,而在感病品种巴西蕉中表达量呈下降趋势.表明MaNPR4及MaNPR11参与香蕉抗枯萎病过程.本研究结果为进一步利用香蕉NPR1基因进行香蕉抗枯萎病遗传改良奠定基础.

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