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miR-370-3p在绵羊中的表达、生物信息学分析与靶基因预测

文献类型： 中文期刊

作者： 王丹 1 ; 张双双 1 ; 贾琪 1 ; 张新玉 1 ; 付佳棋 1 ; 张立春 1 ; 孙福亮 1 ;

作者机构： 1.延边大学农学院;吉林省农业科学院动物生物技术研究所

关键词： 绵羊;miR-370-3p;靶基因;表达分析;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年 60 卷 002 期

页码： 226-230,237

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以新吉细毛羊和小尾寒羊为实验动物,用实时荧光定量PCR检测miR-370-3p在绵羊不同组织中的表达变化;利用Mega11.0 对 miR-370-3p进行序列分析,并构建进化树;利用miRBase对脊椎动物的miR-370-3p序列进行检索,使用Ensembl数据库对miR-370-3p进行定位;利用在线网站预测miR-370-3p的靶基因,并进行GO、KEGG分析.组织表达结果显示,miR-370-3p在 2 种绵羊 1 月份和 10 月份的皮肤组织中均存在显著差异;在 2 种绵羊同组织间均存在显著差异.miR-370-3p序列主要存在于哺乳动物,且在不同物种间高度保守;miR-370-3p共有 315 个靶基因;GO分析结果显示靶基因主要富集在蛋白质的自磷酸化、细胞核与细胞质的运输、神经元凋亡过程等方面;KEGG通路分析表明靶基因主要富集到MAPK信号通路、寿命调节通路和细胞内吞作用等,其中多个与毛囊生长发育相关的基因富集到相关通路之上.绵羊miR-370-3p在皮肤组织存在时空表达差异,在各组织间广泛表达,可能通过靶向MAPK信号通路及寿命调节等通路参与调控毛囊的生长发育.

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