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矮小芦花鸡线粒体DNA D-loop序列变异起源分化研究

文献类型： 中文期刊

作者： 栾祜 1 ; 缪立生 1 ; 柳俭强 1 ; 陈小辛 1 ; 张立春 1 ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院畜牧兽医所

关键词： 矮小芦花鸡;线粒体DNA D-loop;核苷酸多样性;单倍型多样性;平均核苷酸差异数

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2025 年 61 卷 009 期

页码： 227-233

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在探索吉林省矮小芦花鸡这一独特地方品种的遗传多样性和母系起源.通过对矮小芦花鸡线粒体DNA D-loop区序列的分析,揭示该品种的遗传结构及其历史演化路径,为有效保护和利用这一珍贵的遗传资源,以及未来的选育和遗传改良工作提供坚实的理论基础.本研究以 34 只矮小芦花鸡为研究对象,针对其线粒体DNA D-loop区域开展PCR扩增、测序及比对分析,系统评估该品种的遗传多样性特征与母系起源.研究获得长度为1 052 bp的D-loop序列,碱基组成分析显示A+T含量(54.4%)显著高于G+C含量(45.6%),呈现出明显的碱基偏向性特征.通过序列比对共检测到 21 个变异位点,其中包含 6 个单一变异位点和 15 个简约信息位点.具体而言,变异类型包括 3 处单碱基插入事件,所有变异均表现为单碱基替换(20 个转换+1个颠换),其中T-C转换 14 次(占比 66.7%)、A-G转换 6 次(占比 28.6%)、A-C颠换 1 次(占比 4.7%).遗传多样性分析显示:核苷酸多样性(Pi)为 0.007 64±0.001 4,单倍型多样性(Hd)达 0.872±0.027,平均核苷酸差异数(K)为 6.067,表明该群体存在丰富的核苷酸变异.序列分析共鉴定出 9 种单倍型,单倍型间遗传距离范围为 0.001~0.016.系统发育关系重建显示该群体分化为 3 个独立的线粒体谱系,不仅证实了其存在 3 个母系起源,更揭示了群体内部个体间遗传距离较近的特性.上述研究结果充分表明矮小芦花鸡具有较高的遗传多样性水平,亟需加强该珍贵地方品种的遗传资源保护与系统性保育工作.

  • 相关文献

[1]吉林矮小芦花鸡早期生长曲线拟合及相关分析. 柳俭强,刘臣,张芳毓,武斌,曹阳,肖成,刘艳光,刘洪亮,张立春. 2020

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