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新疆、甘肃黍稷资源的遗传多样性与群体遗传结构研究

文献类型: 中文期刊

作者: 薛延桃 1 ; 陆平 2 ; 史梦莎 3 ; 孙昊月; 刘敏轩; 王瑞云;

作者机构: 1.中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081;山西农业大学农学院, 山西太谷 030801

2.中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081

3.山西农业大学农学院, 山西太谷 030801;山西省农业科学院农作物品种资源研究所 /农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 / 杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室, 山西太原 030031

关键词: 黍稷;新疆;甘肃;SSR标记;遗传多样性

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2019 年 45 卷 10 期

页码: 1511-1521

摘要: 新疆、甘肃是我国古代丝绸之路的必经之地,同时也是黍稷的主要种植区.研究该地区黍稷种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对于开展黍稷起源进化研究,明确黍稷传播路径具有重要的意义.本研究利用103对SSR标记对来自新疆、甘肃的216份黍稷资源进行了遗传多样性分析,共检测到299个等位基因,平均每个位点产生2.9个等位基因,平均Shannon's指数为0.7360,平均观测杂合度为0.6298,平均期望杂合度为0.5497,多态性信息含量指数为0.0688~0.7786,均值0.4714,具有中度多态性.216份黍稷资源的近交系数为0.5870,遗传分化系数为0.0383,遗传分化程度很小.甘肃资源的等位基因数、Shannon-Weaver多样性指数、Nei's期望杂合度和PIC值分别为2.8252、0.7347、0.4501和0.4674,其遗传参数值均大于新疆资源,表明甘肃种质资源的遗传多样性较新疆更丰富.基于遗传距离的聚类分析将216份黍稷资源分为5个类群,类群I~IV共包含7份黍稷资源,与别的资源遗传关系较远;96%的资源集中于类群V,在遗传距离为0.38处,类群V又分为4个亚群,亚群A和亚群D主要包含甘肃资源,亚群B和亚群C主要包含新疆资源,表明新疆与甘肃资源有明显分离和相互渗透现象.聚类分析与群体遗传结构分析结果相似,均与生态地理分布相关.

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