您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李大宇 1 ; 殷倩茜 1 ; 侯宁 1 ; 孙效文 1 ; 梁利群 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 黄颡鱼;遗传多样性;分子标记;微卫星

期刊名称: 海洋与湖沼

ISSN: 0029-814X

年卷期: 2009 年 40 卷 04 期

页码: 78-87

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用40个黄颡鱼微卫星分子标记对吉林省月亮湖野生黄颡鱼(YL,30尾)、四川野生黄颡鱼(SC,30尾)、黑龙江省哈尔滨市松花江段黄颡鱼(SH,18尾)、湖北省荆州市长湖野生黄颡鱼子代(YY,30尾)及其亲本(QQ,30尾)、天津市换新国家级原良种场黄颡鱼1号(TJ,30尾)6个黄颡鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,x2检验估计Hardy-Weinberg平衡,采用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。6个群体共检测到5042个扩增片段,长度在150—650bp,40个基因座扩增出等位基因数从1—8个不等,共计143个等位基因,平均每个基因座扩增得到3.575个等位基因。结果显示:(1)6个黄颡鱼群体的多态性指标均适中,PIC在0.00—0.79之间,平均值为0.40、0.37、0.35、0.39、0.35和0.19,有效等位基因数(Ae)1.00—5.44个不等,平均有效等位基因数依次为2.05、2.30、1.93、2.07、1.93和1.47,无偏期望杂合度(He)在0.00—0.83之间,平均值为0.45、0.46、0.36、0.46、0.41和0.23;(2)遗传相似系数YY与QQ遗传相似度最高(0.9947),TJ与SC遗传相似系数最低(0.4846),聚类结果与地理分布呈一定相关性。

  • 相关文献

[1]大龙虎泡野生日本沼虾遗传多样性分析. 兰若林,马文智,张立民,孙博,常玉梅,梁利群. 2023

[2]黄颡鱼微卫星标记的筛选及三个野生群体的遗传结构分析. 吴勤超,梁宏伟,李忠,呼光富,罗相忠,沈子伟,邹桂伟. 2010

[3]黄颡鱼RAPD标记及其遗传多样性的初步分析. 宋平,潘云峰,向筑,胡珈瑞,胡隐昌,蔡从利. 2001

[4]黄颡鱼群体遗传变异分析. 周伟,王俊,金斌松,高天翔,宋娜. 2016

[5]基于D-loop序列和微卫星标记的4个黄颡鱼群体的遗传变异分析. 李兵部,傅建军,陶易凡,强俊,徐跑. 2024

[6]魁蚶微卫星富集文库的构建及不同地理种群遗传多样性分析. 田吉腾,刘志鸿,杨爱国,刘萍. 2011

[7]江西三种红鲤群体遗传多样性及亲缘关系的SSR分析. 刘福军,贾智英,孙效文. 2008

[8]鳙鱼微卫星分子标记的筛选. 鲁翠云,孙效文,梁利群. 2005

[9]斑马鱼微卫星分子标记检测鲤鱼种间多态性. 全迎春,梁利群,孙效文,姚昆,雷清泉. 2006

[10]微卫星标记对德国镜鲤选育群体的遗传分析. 李超,鲁翠云,曹顶臣,李崇文,孙效文. 2012

[11]青虾生长性状相关的微卫星标记筛选. 傅洪拓,万山青,付春鹏,乔慧,吴滟,龚永生,蒋速飞,熊贻伟. 2010

[12]合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选. 李小宁,张殿昌,朱彩艳,苏天凤,江世贵. 2009

[13]大菱鲆4个引进地理群体遗传多样性的微卫星分析. 侯仕营,马爱军,王新安,黄智慧,薛宝贵,杨志,曲江波. 2011

[14]4个虹鳟养殖品系的分子鉴定和遗传多样性分析. 徐浩,鲁翠云,郭薇,孙效文. 2013

[15]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 2008

[16]利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性. 孙莉,杨国梁,王军毅,吴婷婷,张海波,吴添文,陈国宏. 2009

[17]利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状. 徐浩,鲁翠云,孙效文. 2013

[18]漠斑牙鲆养殖群体微卫星遗传多样性的初步分析. 覃盼,廖梅杰,徐永江,潘传燕,李彬,王印庚,张正. 2013

[19]野生亚东鲑群体遗传多样性及其种质来源研究. 户国,王芳,周建设,潘瑛子,李宝海,谷伟,孙鹏,白庆利,王炳谦. 2016

[20]中国海南三亚大珠母贝不同年代种群的遗传变异研究. 柳明,喻达辉,黄桂菊,卢传亮. 2011

作者其他论文 更多>>