文献类型： 中文期刊
作者： 刘艳丽 1 ; 周媛 2 ; 曹丹 1 ; 马林龙 1 ; 龚自明 1 ; 金孝芳 1 ;
作者机构： 1.湖北省农业科学院
2.中国科学院武汉植物园
关键词： 茶;蛋白质;亚细胞定位;预测
期刊名称： 植物科学学报
ISSN： 2095-0837
年卷期： 2020 年 38 卷 005 期
页码： 671-677
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 以500个茶(Camellia sinensis(L.)O.Ktze.)叶片的蛋白质作为数据集,比较TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4种软件预测亚细胞定位的可信度和灵敏度.结果显示,4种软件预测可信度均高于80%,依次排序为TargetP>LocTree>WoLF PSORT>Plant-mPLoc.其中,LocTree对细胞质蛋白和分泌蛋白检测灵敏度最高,但对叶绿体蛋白灵敏度最低;Plant-mPLoc检测核蛋白最灵敏,但对细胞质蛋白最不敏感;TargetP检测叶绿体蛋白最灵敏,但仅能区分3个亚细胞器官;WoLF PSORT对分泌蛋白检测灵敏度最低,但对其他蛋白均较灵敏.基于上述结果,该研究针对4种软件提出了合理的使用建议.
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