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陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 倪万潮 1 ; 徐珍珍 1 ; 沈新莲 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室

关键词： 陆地棉;ZF-HD蛋白;生物信息;组织表达分析

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 06 期

页码： 519-526

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共有35个Gh ZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分Gh ZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少。

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