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香蕉束顶病毒海口分离物基因组的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 冯团诚 1 ; 王健华 1 ; 刘志昕 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室

关键词： 香蕉束顶病毒;基因克隆;序列分析

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2010 年 40 卷 01 期

页码： 40-50

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以海口香蕉束顶病株的幼嫩假茎和叶片总DNA为模板,通过反向PCR法克隆了香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)海口分离物(命名为BBTV-HaiKou)的6个DNA组分的全长序列。结果表明,DNA1～6序列全长分别为1106、1040、1058、1040、1013和1082nt。各组分非编码区各包含一个茎环共同区和一个主要共同区,同源性分别为91.55%和88.45%。各组分编码区均编码一个开放可读框(ORF),其中DNA1 ORF内部还有一个小的ORF。序列分析表明,BBTV-HaiKou分离物与其它分离物间的DNA1最为保守,DNA2变异最大。DNA1组分核苷酸序列与亚洲组、南太平洋组各分离物及ABTV(Abacá bunchy top virus)分离物同源性分别为93.1%～99.1%,89.6%～90.7%和76.2%～77.4%,相应的编码蛋白氨基酸序列同源性在BBTV和ABTV中分别为93.4%～100%和85.7%。根据Karan等的分类方法,确定BBTV-HaiKou分离物属于亚洲组成员。

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