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番茄20S蛋白酶体基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 闫超凡 1 ; 孙雪梅 1 ; 钟启文 1 ; 邵登魁 1 ; 邓昌蓉 1 ; 文军琴 1 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院园艺研究所

关键词: 番茄;20S蛋白酶体;泛素—蛋白酶体系统;生物信息分析

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 266-280

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 20S蛋白酶体能够通过自身或泛素—蛋白酶体系统特异性降解细胞质和细胞核中的蛋白质,维持细胞蛋白质稳态。本研究中鉴定出21个番茄(Solanum lycopersicum L.)20S蛋白酶体基因家族成员,并对其进行生物信息分析。结果表明,番茄20S蛋白酶体大多数基因含有相似的启动子和内含子,其中,编码α亚基的基因保守性较好,而编码β亚基的基因保守性较差;亚细胞定位发现,绝大多数基因在细胞质中发挥功能;染色体定位和基因复制分析发现,21个20S蛋白酶体基因不均匀地分布在12条染色体上,存在2对片段复制基因对;进化分析表明,编码α亚基和编码β亚基的基因被划分在不同的类群或亚群;多物种共线性分析发现,番茄与辣椒(Capsicum annuum L.)和马铃薯(Solanum tuberosum L.)之间的同源基因对较多,而与拟南芥[Arabidopsis thaliana(L.)Heynh.]、水稻(Oryza sativa L.)和玉米(Zea mays L.)同源的基因对较少。SlPRA1-01、SlPRA10-04、SlPRA11-05和SlPRA16-09这4个基因在3个物种中均形成基因对;启动子和组织特异性表达分析结果显示,20S蛋白酶体基因家族在番茄逆境胁迫和生长发育中发挥着重要作用。

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