文献类型： 中文期刊
作者： 陈付英 1 ; 牛晖 1 ; 施巧婷 1 ; 滑留帅 1 ; 冯亚杰 1 ; 徐照学 1 ; 王二耀 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省肉牛工程技术研究中心有限公司;河南牧业经济学院
关键词： 郏县红牛;生长性状;SLAF-seq;全基因组关联分析;候选基因
期刊名称： 中国牛业科学
ISSN： 1001-9111
年卷期： 2018 年 05 期
页码： 24-28
摘要： 本研究的目的是分析郏县红牛生长性状遗传基础,筛选与生长性状相关的候选基因。运用SLAF-seq简化测序技术,通过全基因组关联分析,筛选出3个与郏县红牛生长性状相关的SNP位点,rs449748996位点与18月龄体高显著相关(P=9.88E-13),rs210024569与6月龄体高潜在显著相关(P=9.53E-08),rs42177491与12月龄胸围潜在显著相关(P=2.71E-07)。在每个SNP周围1Mb区域内筛选相关基因,并对之进行GO数据库分析,发现rs449748996位点所在的LOC100337124基因可以作为18月龄体高性状的候选基因;rs210024569位点所在的C6orf106基因可以作为6月龄体高性状的候选基因;rs42177491位点所在的JAM3基因能否作为12月龄胸围的候选基因还需要进一步验证。
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