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西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1-z基因的分离与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蒋璐 1 ; 束红梅 2 ; 巩元勇 2 ; 孙雨茜 2 ; 郭书巧 2 ; 倪万潮 2 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物所/江苏省生物学重点实验室

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关键词： 西红花;β-胡萝卜素羟酶;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2019 年 016 期

页码： 46-53

收录情况： CSCD

摘要： 为更好地理解西红花类胡萝卜素合成代谢途径,从西红花中分离和克隆了1个新的β-胡萝卜素羟化酶基因CsBCH1-z,并从柱头cDNA中克隆了该基因的全长编码序列为906 bp,编码301个氨基酸残基,对应的基因组序列为1261 bp,5个外显子由4个内含子子间隔开.与已知的CsBCH1基因的氨基酸序列比较,发现在N端由于6个碱基的缺失,造成了2个氨基酸的缺失和1个氨基酸由异亮氨酸突变为亮氨酸,另外还有一处单碱基的变异造成苏氨酸突变为丙氨酸.通过预测其蛋白含有3个明显的跨膜结构域,C端包含了2组"HXXXXH"和"HXXHH"结构域,是典型的脂肪酸羟化酶.β-胡萝卜素羟化酶是西红花苷合成的重要前体物质,CsBCH1-z柱头中的表达量>叶片>花瓣;雄蕊中表达很低;球茎中表达不可见.

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