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基因密码子与互补密码子使用的相关分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄惠芳 1 ; 林鲁萍 1 ; 马飞 1 ; 许晓风 2 ; 陈礼明 1 ; 陈学平 3 ; 武耀廷 4 ;

作者机构: 1.厦门大学生命科学学院

2.南京师范大学生命科学学院

3.中国科学技术大学经济技术学院

4.中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室

关键词: 密码子;互补密码子;使用相关;进化

期刊名称: 安徽农业大学学报

ISSN: 1000-2197

年卷期: 2004 年 31 卷 03 期

页码: 263-268

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 遗传密码是基因与蛋白质进行信息对接的桥梁,研究不同进化阶层生物的密码子与互补密码子的使用规律是揭示物种进化的一种重要途径。为了阐明不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用之间的内在联系及其在进化中的意义,作者选取了44种细胞生物、16种病毒、40种线粒体和20种叶绿体的基因密码子与互补密码子数据,并进行关联分析。结果显示:(1)无论是古细菌,真细菌,病毒,真核生物还是两类细胞器,它们的密码子与互补密码子的使用频率大多表现为显著或极显著正相关;(2)不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用频率之间相关程度也存在明显的异质性。细胞生物和两类细胞器基因密码子与互补密码子使用的高度一致性反映了它们可能具有共同的起源,显著的异质性则反映了它们分别经历了不同的进化选择压力。密码子与互补密码子的使用相关程度不仅能被用作为测量物种进化过程中所经历选择压力的指标,而且也能被用作为碱基摆动和修饰的指示器。此外,文中还对生物进化早期存在DNA双链同时具有编码基因功能的可能性进行了讨论。

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