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基因组选择及其应用

文献类型： 中文期刊

作者： 李恒德 1 ; 包振民 2 ; 孙效文 3 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院生物技术研究中心

2.中国海洋大学海洋生命学院

3.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 基因组选择;高通量遗传标记;育种值估计

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2011 年 33 卷 12 期

页码： 1308-1316

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 品种选育在农业生产中占有十分重要的地位,育种值估计是品种选育的核心。随着遗传标记的发展,尤其是高通量的基因分型技术,使得从基因组水平估计育种值成为可能,即基因组选择。文章将基因组选择的方法分为两类:一是基于估计等位基因效应来预测基因组估计育种值(GEBV),如最小二乘法,随机回归-最佳线性无偏预测(RR-BLUP)、Bayes、主成分分析等方法;二是基于遗传关系矩阵来预测GEBV,通过采用高通量标记构建个体间的遗传关系矩阵,然后用线性混合模型来预测育种值,即GBLUP法,并以这两种分类简要介绍了基因组选择各种方法的大致原理。影响基因组选择准确性的因素主要有标记类型和密度、单倍型长度、参考群体大小和标记-数量性状基因座(QTL)连锁不平衡(LD)大小等;在基因组选择的各种方法中,一般说来Bayes方法和GBLUP方法具有较高的准确性,最小二乘法最差;GBLUP计算速度快,能够将标记和系谱结合起来,因而比其他方法更具优势。尽管基因组选择取得了很大进展,但在理论方面还面临着一些挑战,如联合育种、长期选择的遗传进展及如何解析与性状有关和无关的标记等。基因组选择在一些动植物育种上已经开始应用,在人类遗传倾向预测和进化动力学研究中也有潜在的应用前景。基因组选择在个体间亲缘关系的量化上有了突破,比传统方法更加精确,因此,基因组选择将会是动植物育种史上革命性的事件。

  • 相关文献

[1]水产动物育种值估计方法及其应用的研究进展. 栾生,孔杰,王清印. 2008

[2]基因组选择技术在半滑舌鳎"鳎优1号"新品种培育中的应用研究. 卢昇,李仰真,王磊,刘洋,程向明,周茜,杨英明,郑卫卫,陈松林. 2022

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