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新疆7个小麦种5S rDNA及其NTS序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 米日古丽·马木提 1 ; 玉山江·麦麦提 2 ; 托乎提·艾买提 3 ; 李继洋 4 ; 何丹 5 ;

作者机构: 1.新疆大学生命科学与技术学院新疆农业科学院核技术生物技术研究所

2.新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室新疆农业科学院农产品贮藏加工研究所

3.新疆农业科学院综合试验场新疆农业科学院墨玉农业试验站

4.新疆农业大学农学院

5.广西兽医防疫检疫站

关键词: 新疆小麦;5S rDNA;NTS;亲缘关系;序列分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2014 年 12 卷 05 期

页码: 47-56

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究参照GeneBank中禾本科植物大麦5S rDNA序列,利用PCR技术扩增获得新疆7个小麦种5S rDNA部分序列,进一步与禾本科植物大麦5S rRNA序列比对,得到了5S rDNA结构和NTS边界范围。序列分析发现,不同类型小麦5S rDNA序列保守程度不同,其中大片段保守性较高,小片段相对较低,7个小麦种5S rDNA序列均存在不同程度的插入和缺失序列,同种不同类型和不同种5S rDNA非转录间隔区(NTS)长度和存在位置均呈现不同程度差异。利用MEGA4.0软件,采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建分子进化树并计算种间遗传距离。以7个小麦种进化关系的分析结果为依据,利用5S rDNA两种类型片段建立了两种不同的亲缘关系分类依据,旨在为新疆7个小麦种亲缘关系分析提供一定理论依据,以期为后期种间同源关系分析,建立序列集合,推导系统进化与发育关系,重建发育史和遗传育种奠定一定理论依据。

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