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亚麻NBS类抗病基因家族全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谢冬微 1 ; 路颖 1 ; 赵德宝 1 ; 杨学 1 ; 粟建光 2 ; 孙健 3 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院经济作物研究所

2.中国农业科学院麻类研究所

3.东北农业大学农学院

关键词： 亚麻;NBS类抗病基因;全基因组;生物信息学

期刊名称： 中国麻业科学

ISSN： 1671-3532

年卷期： 2015 年 03 期

页码： 113-119+125

摘要： 亚麻基因组测序完成为全基因组水平分析抗病基因提供了前提条件,而NBS类抗病基因是植物中最大的抗病基因家族之一。本研究利用生物信息学方法对亚麻全基因组中NBS类抗病基因进行了鉴定,对NBS类抗病蛋白的理化性质、基因结构、保守基序及其系统发生关系进行了分析。结果表明:在亚麻全基因组中共找到137个NBS类抗病基因,其中分子量大于100k Da序列比例在50%以上,等电点值在5~8的范围内比例为70.07%。系统进化树将NBS类基因分成7个亚组,且同一亚组内基因的结构和保守基序保持着较高的一致性。本研究的结果将为亚麻NBS类抗病基因家族的基因定位以及相关抗病基因克隆等深入研究提供参考。

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