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刀鲚Δ6脂肪酸去饱和酶cDNA的克隆与组织表达检测

文献类型: 中文期刊

作者: 魏广莲 1 ; 徐钢春 2 ; 顾若波 2 ; 杜富宽 2 ; 徐跑 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.南京农业大学无锡渔业学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

关键词: 刀鲚;Δ6脂肪酸去饱和酶;基因克隆;基因表达

期刊名称: 南京农业大学学报

ISSN: 1000-2030

年卷期: 2014 年 37 卷 03 期

页码: 138-144

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用RT-PCR和RACE技术获得刀鲚(Coilia nasus)Δ6脂肪酸去饱和酶(Δ6 fatty acyl desaturase,FAD6)的全长cDNA序列2 032 bp,开放阅读框(ORF)为1 338 bp,编码445个氨基酸。其具有3个保守的组氨酸簇(HDXGH、HXXHH和QXXHH)、2个跨膜区和含亚铁血红素结合基序(HPGG)的细胞色素b5结构域等典型的Δ6脂肪酸去饱和酶结构特点。氨基酸同源性分析显示,刀鲚FAD6与海鳗(Muraenesox cinereus)和军曹鱼(Rachycentron canadum)等海水鱼类的相似性达75%~79%,而与淡水鱼类的相似性较低。系统进化分析也显示,其与海水鱼类的亲缘关系较近。荧光定量PCR检测发现该基因在刀鲚脑和肠中高表达,肌肉和肝脏相对高表达,心脏、肾脏和鳃低表达。

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