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西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何丹 1 ; 海利力·库尔班 1 ; 玉山江·麦麦提 2 ; 李继阳 1 ; 杨渡 2 ; 韩盛 2 ;

作者机构： 1.新疆农业大学林学与园艺学院

2.新疆农业科学院植物保护研究所

关键词： 甜瓜;西瓜花叶病毒;外壳蛋白;序列分析

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2015 年 52 卷 10 期

页码： 1849-1858

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究新疆甜瓜主栽区西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白的分类地位,以及与国内外分离株亲缘关系。【方法】田间采集具有西瓜花叶病毒症状的幼嫩叶片,利用改良的TRIZOL总RNA提取法获取RNA,进一步分离纯化、克隆及测序,将测序结果利用BLAST、DNAMAN 5.0、CLUSTALX、MEGA 5.0 EXPASY、TMHMM等软件进行碱基和氨基酸序列比对,以及疏水性平均值、脂肪系数、亲缘关系等分析。【结果】序列比对发现8个地区WMV病毒外壳蛋白核酸序列的5'端保守性较高,碱基和氨基酸序列相似性分别达到86.25%和93.01%,存在部分碱基和氨基酸突变,相似性较高。【结论】通过分子进化树可得出新疆8个分离物之间亲缘性关系较近,同源性较高,与国内外其它地区的亲缘性关系较远、同源性较低。

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