您好,欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库!

DNA条形码专用R包及其主要功能简介

文献类型: 中文期刊

作者: 金倩 1 ; 阮倩倩 2 ; 陈芬 2 ; 罗桂杰 2 ; 张爱兵 3 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院宿迁农科所;首都师范大学生命科学学院

2.;江苏省农业科学院宿迁农科所;首都师范大学生命科学学院

3.;江苏省农业科学院宿迁农科所;首都师范大学生命科学学院;

关键词: DNA条形码;R语言;SPIDER;BarcodingR

期刊名称: 环境昆虫学报

ISSN: 1674-0858

年卷期: 2017 年 03 期

页码: 485-492

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: S_(PIDER)和BarcodingR软件包作为DNA条形码研究的专用R软件包,整合了基于DNA条形码的物种识别算法和数据分析策略,避免了各种非商业用途软件的局限性,为DNA条形码的研究提供了便捷性和可操作性。本文对SPIDER和BarcodingR软件包的主要功能进行整体介绍,并以西藏夜蛾科COI、松毛虫属ITS等数据为例,进行主要函数的演示分析,希望为昆虫DNA条码的应用分析提供帮助。

  • 相关文献

[1]基于Web of Science的啤酒大麦产量和品质文献计量分析. 李宇星,梁志浩,郭爱奎,乔海龙,徐肖,张英虎,杨红燕,程怡璠,汪强,薛松,于文青,沈会权. 2024

[2]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究-以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

[3]DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定. 陈亚辉,朱海军,生静雅,张普娟,鲍瑾,刘广勤. 2013

[4]基于DNA条形码的物种丰富度估计:以宿迁地区鳞翅目蛾类为例. 金倩,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,王昊,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2016

[5]青藏高原地区不同环境条件下鳞翅目昆虫物种多样性与系统发育多样性的初步研究. 金倩,阮倩倩,陈芬,刘博,蔡卫佳,张爱兵. 2018

[6]识别杜洛克猪个体身份的DNA条形码. 丁潜,邢光东,胡肄农,纪红军,赵庆顺,徐银学. 2014

[7]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

[8]寄生蜂DNA条形码研究进展与展望. 孙星星,蒋颖洁,王凡,张礼生. 2025

[9]DNA条形码技术在桃蚜寄生蜂鉴定上的应用. 孙星星,陈永成,王凡,蒋颖洁,王凯,胡积祥,高波,李红阳,顾慧玲,张礼生. 2024

作者其他论文 更多>>