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不同品种绵羊D-loop区遗传多样性研究

文献类型: 中文期刊

作者: 肖帆 1 ; 张利平 1 ; 朗侠 2 ; 吴建平 2 ; 张筱艳 1 ; 靳继鹏 1 ;

作者机构: 1.甘肃农业大学动物科学技术学院

2.甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所

关键词: 绵羊;线粒体DNA D-loop;遗传多样性

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2021 年 30 卷 008 期

页码: 1122-1129

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 线粒体DNA(Mitochondria DNA,mtDNA) D-loop区的进化速度快且多态性丰富,因此在生物的遗传多样性和起源进化研究中具有重要意义.采用PCR扩增和基因测序的方法分析甘肃高山细毛羊(G)、欧拉羊(O)、杜泊羊(D)、蒙古羊(M)、小尾寒羊(S)和湖羊(H)的线粒体DNA D-loop区遗传多样性和进化关系.结果 显示,试验羊D-loop区中GC含量低于AT含量,共检测到171个变异位点,单一多态位点58个,简约信息位点113个,共87个单倍型,单倍型多样度(Hd)分别为0.993、1.000、0.968、1.000、0.933和1.000,核苷酸多样度(Pi)分别为0.02237、0.01463、0.01193、0.01747、0.02140和0.02348,湖羊的平均核苷酸差异度最大(K=31.622),而杜泊羊最小(K=15.995).蒙古羊和杜泊羊的核苷酸平均差异数Kxy最大,蒙古羊和欧拉羊的核苷酸平均差异数Kxy最小.核苷酸歧异度Dxy与核苷酸平均差异数Kxy结果一致.系统发育树结果显示,湖羊与小尾寒羊先聚集在一起,然后与杜泊羊聚为一类;欧拉羊与蒙古羊先聚为一类,然后与甘肃高山细毛羊聚为一大类,说明湖羊与小尾寒羊遗传差异小.

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