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大豆耐涝bZIP转录因子Glyma06g08390的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林昊 1 ; 徐靖 1 ; 朱红林 1 ; 唐力琼 1 ; 林延慧 1 ; 王效宁 1 ;

作者机构： 1.海南省农业科学院粮食作物研究所

关键词： 大豆;耐涝;转录组;bZIP转录因子;MAPK信号通路

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 021 期

页码： 6970-6974

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： bZIP转录因子在响应不同非生物胁迫中起着重要作用.本研究以耐涝性强大豆品种'齐黄34'作为材料,对其进行没顶淹水处理,取样进行转录组测序,筛选出1个差异表达的bZIP转录因子Gly-ma06g08390,并对其进行RT-qPCR检测,结果与转录组测序数据趋势一致,呈现上调表达.分析Gly-ma06g08390蛋白的保守结构域,发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域.蛋白三级结构中存在与寡聚化作用的亮氨酸拉链区.预测与Glyma06g08390蛋白互作的蛋白,结果发现有两个蛋白是MAPK信号通路中的蛋白,分别MAPK2和MAPKK2.因此,我们推测Glyma06g08390可能与MAPK2和MAPKK2发生互作,激发了 MAPK信号通路来响应涝害胁迫.

  • 相关文献

[1]大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测. 林延慧,唐力琼,徐靖,朱红林,王新华,王敏芬,徐冉,王效宁. 2020

[2]基于RNA-Seq的莲雾密码子偏好性分析. 胡福初,陈哲,郭利军,罗志文,陈业光,范鸿雁,王祥和. 2017

[3]菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选. 庞强强,孙晓东,周曼,蔡兴来,陈贻诵,王亚强. 2024

[4]连作对大豆根际微生物群落及营养的影响. LI Wei-qun,李伟群. 2012

[5]大豆品质育种研究进展. 王海杰,林家贵,王敏芬. 2015

[6]大豆生育期性状QTL定位. 王海杰,杨存义,江炳志,赵青松,陈淑珍,年海. 2010

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