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民猪保种群体的遗传基础分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张冬杰 1 ; 何鑫淼 1 ; 田明 1 ; 王文涛 1 ; 李忠秋 1 ; 李桂伟 1 ; 朱颖 1 ; 刘娣 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院畜牧研究所;农业农村部种养结合重点实验室;黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院;黑龙江东北虎林园中国横道河子猫科动物饲养繁育中心

关键词: 民猪;基因芯片;亲缘关系;血统;因果突变

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2022 年 03 期

页码: 64-67+131

收录情况: 北大核心

摘要: 为了科学准确地划分现有民猪保种群体的亲缘关系及家系结构,试验采用猪的"中芯一号"育种芯片检测了70头民猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP);使用MEGAX(V10.0)和R软件进行公畜样本及全部样本的聚类分析,使用Plink(V1.90)和R软件等进行近交系数的计算及因果突变分析,并统计分析影响猪的肉质性状、生长和体型性状、繁殖性状和抗病性性状等11个基因的基因型。结果表明:民猪保种群内的20头公猪可划分为5个血统,49头母猪可分别划入这5个血统,但有1头个体与这5个血统均不存在亲缘关系,而被归为"其他"。群体平均近交系数为0.11,属于中度近交。在因果突变分析中,该群体内氟烷基因和酸肉基因还未得到净化;采食量、抗仔猪腹泻和料肉比的优势等位基因占比较高,但影响多肋骨数和多胸椎数的优势等位基因占比非常低,还有较大的选择空间。说明未来该民猪保种群体要尽量避免近交,考虑引入新的公猪血统,尽快剔除携带有劣势基因型的个体,提升种群的生产性能。

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