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基于转录组测序的乌桕叶色相关基因的挖掘

文献类型： 中文期刊

作者： 王晓晓 1 ; 郑旭 1 ; 赵文静 1 ; 缪美华 1 ; 刘兴满 1 ;

作者机构： 1.连云港市农业科学院

关键词： 乌桕;叶色变化;转录组;基因挖掘;分子机制;呈色

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 40 卷 008 期

页码： 1521-1532

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 乌桕(Triadica sebifera)耐盐碱能力强，叶色随季节变化显著，尤以秋季观赏性最佳，是园林绿化中常用的彩叶植物。为揭示乌桕叶片呈色的分子机制，本研究对自主选育的3个乌桕品种连桕1号、云台红桕、云台金桕转色前后的叶片进行转录组测序，共获得123.78 GB测序数据，70 815个高质量单一基因序列(Unigenes),其中48 367个Unigenes得到了功能注释。将3个乌桕品种转色前后的转录组数据进行两两对比，各比较组之间鉴定出共有的差异表达基因(DEG)2 674个。GO分析发现，DEG主要与细胞过程、细胞、结合等生物学功能相关。通过KEGG Pathway功能分析，筛选出53个与乌桕叶色相关的DEG,包括与花青素合成有关的基因14个，与卟啉和叶绿素代谢有关的基因22个，与类胡萝卜素生物合成有关的基因17个。其中花青素合成途径相关基因在乌桕转色后相对表达量上升，叶绿素、类胡萝卜素合成途径相关基因相对表达量下降，而叶绿素、类胡萝卜素降解途径相关基因相对表达量上升，该结果与叶片中色素含量的变化趋势一致。本研究结果可为探究乌桕叶片呈色机制提供理论依据。

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