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基于NCBI数据库的油棕EST-SSR标记的开发与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 夏薇 1 ; 肖勇 1 ; 杨耀东 1 ; 沈雁 1 ; 雷新涛 1 ; 马子龙 2 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究

关键词: 油棕;SSR;多态性;平均遗传距离;遗传结构

期刊名称: 广东农业科学

ISSN: 1004-874X

年卷期: 2014 年 41 卷 02 期

页码: 144-148+166

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用NCBI网站上释放的41 977条油棕EST序列,从中挖掘SSR位点3 946个,根据27个SSR位点的侧翼序列设计引物,并对18份油棕DNA样品进行扩增,扩增结果显示10个标记具有多态性。根据这些标记信息,对这18份油棕资源进行主成分分析,18份油棕资源被分成两个遗传群体,一个为文昌高隆湾和文昌椰子研究所的油棕资源,另一个群体为10份引自马来西亚的油棕资源。这些研究显示,开发的标记可用于油棕资源遗传多样性评估、遗传结构评估,并可用于油棕遗传图谱的构建。

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