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茄子PARMS反应体系的建立与优化

文献类型： 中文期刊

作者： 肖熙鸥 1 ; 赵秋芳 1 ; 林文秋 1 ; 欧雄常 1 ; 冯恩友 2 ; 莫定鸣 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

2.湛江市农业科学研究院

关键词： 茄子;SNP;PARMS;反应体系优化

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 018 期

页码： 6074-6079

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS （Penta-primer amplification re-fractory mutation system） SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1μL DNA模板（10～100 ng/μL）,3μL PARMS mix （2×）,0.45μL引物混合物（100μmol/L）,1.55μL ddH2O。利用WT和L6-5的F2群体验证该体系的稳定性,获得了较好的SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系,为开展茄子种质资源遗传多样性分析、基因定位、指纹图谱构建和分子标记辅助选择等提供了技术支持。

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