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基于2b-RAD技术分析白化茶树品种(系)遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 刘声传 1 ; 许应芬 1 ; 魏杰 2 ; 鄢东海 2 ; 陈智雄 1 ; 徐霖 1 ; 刘燕 1 ; 周玉锋 2 ;

作者机构： 1.贵阳学院生物与环境工程学院

2.贵州省农业科学院茶叶研究所

关键词： 白化茶树;2b-RAD;SNP;遗传多样性

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2022 年 24 卷 008 期

页码： 65-73

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示白化茶树品种(系)的遗传多样性,利用简化基因组测序技术(2b-restriction site-associated DNA,2b-RAD)对23份茶树种质(20份白化,3份常绿对照)进行测序,分析其遗传多样性、亲缘关系和群体结构.结果表明,共获得576 193 750条高质量测序数据和56 498个高质量SNPs.系统发育树和主成分分析表明,23份种质可分为3个类群,类群 Ⅰ为1份来自贵州的大叶种,类群Ⅱ包含来自贵州的地方种质6份,类群Ⅲ包含来自浙江的14份种质和来自安徽、福建的2份种质.基于系统发育树,3个类群的遗传多样性参数均表现为:类群 Ⅰ>类群Ⅱ>类群Ⅲ,类群 Ⅰ和类群Ⅱ、类群Ⅲ之间分别呈现中、高度的遗传分化水平.综上所述,白化茶树品种(系)存在中、高度的遗传分化,不同地理来源的种质间遗传分化更大,为白化茶树种质鉴定、资源利用和育种等提供了理论依据.

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