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基于微卫星多重PCR的黄鳝亲子鉴定技术

文献类型： 中文期刊

作者： 鲁弘毅 1 ; 田海峰 1 ; 胡乔木 1 ; 李忠 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所

关键词： 黄鳝;微卫星;亲子鉴定;多重PCR

期刊名称： 南方水产科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 97-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为助力黄鳝（Monopterus albus）良种选育中的亲子鉴定和系谱管理问题，利用黄鳝全基因组预测并筛选获得的16个多态性较高的微卫星标记，建立了2组微卫星多重PCR体系，并成功用于11个家系的亲子鉴定。通过Cervus 3.0软件对132尾黄鳝进行遗传多样性分析，结果显示，16个微卫星标记的平均等位基因数（Na）为5.562，平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别为0.627和0.619，平均多态信息含量（PIC）为0.564。亲子鉴定结果表明，双亲基因型未知时单亲本的累积排除概率（CE-1P）为0.999 999 99，单亲基因型已知时另一亲本的累积排除概率（CE-2P）为0.999 999 91，双亲基因型未知时双亲的累积排除概率（CE-PP）为0.999 964 76。黄鳝11个家系的模拟鉴定率为99.96%，实际鉴定率为95%。模拟分析不同亲本数的结果显示，实验的16个微卫星标记在双亲性别已知的200对亲本和双亲性别未知的150对亲本的情况下，均可达到95%以上的鉴定率。利用NTSYS软件对11个家系的110尾子代个体进行聚类分析，结果显示除2尾子代外其余108尾子代均可正确聚类，准确率为98.18%。实验构建的2组微卫星多重PCR亲子鉴定技术为黄鳝良种选育及种质资源管理提供了重要技术支持。

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