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3种沼虾的16S rRNA基因序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 程起群 1 ; 樊强国 1 ; 夏连军 1 ; 黄宁宇 1 ;

作者机构： 1.农业部海洋与河口渔业重点实验室中国水产科学研究院东海水产研究所

关键词： 沼虾;16SrRNA;测序;遗传差异

期刊名称： 浙江海洋学院学报(自然科学版)

ISSN： 1008-830X

年卷期： 2007 年 26 卷 01 期

页码： 1-5+16

摘要： 为从分子角度理解3种沼虾,即罗氏沼虾、日本沼虾和祁连沼虾的遗传差异,为沼虾资源的管理、保护和合理开发利用提供理论基础,采集了每种沼虾各2尾样本,采用PCR的方法扩增了其线粒体16S rRNA基因片断并测序。比对后共获得了3种沼虾的297 bp的16S rRNA片断序列,共检测到47个变异位点,总变异率为15.8%。3种沼虾的平均碱基含量分别为T(37.7%)、C(10.9%)、A(29.8%)和G(21.6%)。罗氏沼虾种内个体间序列差异为3%。祁连沼虾和日本沼虾种内个体间差异均为0.7%,且两者种间差异很小,为0～0.7%。罗氏沼虾与祁连沼虾、日本沼虾之间的序列差异在13.1%～14.8%之间,种间差异明显。系统进化树显示罗氏沼虾自成一枝,而日本沼虾和祁连沼虾共同构成另一枝,日本沼虾和祁连沼虾的遗传距离小于5%,结果提示日本沼虾和祁连沼虾有很近的亲缘关系,两者也许是亚种关系。

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