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应用PCR-DGGE技术分析福州左海湖的细菌群落组成

文献类型: 中文期刊

作者: 吕新 1 ; 刘兰英 1 ; 陈丽华 1 ; 李玥仁 1 ; 林碧娇 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所

关键词: 左海湖;细菌群落组成;16SrRNA;PCR-DGGE

期刊名称: 福建农业学报

ISSN: 1008-0384

年卷期: 2016 年 31 卷 09 期

页码: 986-992

收录情况: 北大核心

摘要: 应用PCR-DGGE技术对4个月份(2011年12月、2012年2月、4月、6月)的福州左海湖细菌群落组成和优势菌群进行分析,研究结果发现相同月份4个采样点的DGGE图谱差异性不大,细菌群落组成具有较高的相似性;而不同月份4个采样点的DGGE条带的数目和位置表现出明显差异,细菌群落组成差异明显。对20条不同位置的DGGE条带进行切胶回收、扩增和测序后,进行系统进化分析,结果显示这20条带归属于4个细菌类群,即变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria、蓝细菌门Cyanobacteria。20条序列中有11条鉴定为变形细菌门Proteobacteria、5条鉴定为拟杆菌门Bacteroidetes、2条鉴定为放线菌门Actinobacteria、其余2条属于蓝细菌门Cyanobacteria。研究结果表明,左海湖细菌群落组成包括了Proteobacteria、Bacteroidetes、Actinobacteria、Cyanobacteria,其中以Proteobacteria为优势菌群。

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