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几种典型藻华生物的分子分类学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 侯建军 1 ; 赖红艳 2 ; 黄邦钦 3 ; 刘绍平 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所

2.湖北师范学院生命科学学院

3.厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室

关键词： 藻华生物;分子分类学;核糖体DNA;变形梯度凝胶电泳;随机引物PCR

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2008 年 32 卷 05 期

页码： 711-719

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过PCR克隆测序、rDNA序列分析、随机PCR引物扩增结合DGGE技术等三个层次的分子分类水平对厦门海域的典型藻华生物进行分子生物学分析。结果表明,基于DGGE检测的18S rDNA序列过于保守,分类的精确度不高;AP-PCR则是基于基因组的差异进行分析,结果较为精确和全面;而rDNA序列分析相对可靠,尤其是针对ITS的长度和全序列分析以及28S rDNA的D1、D2区的序列分析,可以提供更为准确的分类信息,并可为设计检测探针提供基础。据此对分离自厦门海域的3种典型甲藻及其相关藻株建立了系统进化树。针对23株甲藻ITS序列建立的系统进化树显示Takayama pulchella(AY764179)和Karlodinium micrum的距离最近,并能够把Akashiwo属、Karenia属、Gyrodinium属、Karlodinium属、Takayama属与Gymnodinium属等区分开。用28S rDNA序列建立的系统发育树只能把Karlodinium属、Karenia属和Takayama属区分开,但不能很好地把无纹环沟藻与Akashiwo属和Gymnodinium等的藻区分开。

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[3]几种帘形目贝类RDNA ITS序列的比较. 刘相全,包振民,胡景杰,王师,方建光,王如才. 2007

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