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大蒜NAC基因家族的鉴定与低温表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 闫艺薇 1 ; 田洁 1 ;

作者机构： 1.青海大学农林科学院

关键词： 大蒜;NAC基因家族;低温胁迫;基因表达

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2023 年 25 卷 004 期

页码： 67-76

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘大蒜NAC转录因子家族成员,研究其在低温胁迫下的表达特性,基于大蒜转录组的测序结果,对低温胁迫下大蒜NAC转录因子家族的响应进行分析.结果表明,共鉴定出49个大蒜NAC基因,根据系统发育特征将其分为10个亚族.大蒜NAC蛋白的序列长度为81~619 aa,分子量9293.66~70229.04 Da,且均为亲水蛋白.保守结构域分析发现,大部分NAC蛋白在N端具有保守性,其中18个NAC蛋白在N端均有motif 3、motif 4、motif 1、motif 2、motif 5 保守域.从中随机挑选 6 个蛋白(AsNAC001、AsNAC010、AsNAC013、AsNAC014、AsNAC017、AsNAC047)对其进行蛋白二级及三级结构的预测,发现无规则卷曲是构成大蒜NAC蛋白的重要组成部分,其次是α-螺旋和延长链,且这6个NAC蛋白具有高度的相似性.实时荧光定量分析发现,检测的6个NAC基因中有4个(AsNAC001、AsNAC010、AsNAC013、AsNAC014)在低温胁迫12和24 h时显著上调表达;2个(AsNAC017、AsNAC047)在低温胁迫4 h时显著下调表达,其中AsNAC010基因的表达量显著高于其他基因,说明NAC转录因子在大蒜响应低温胁迫的过程中起重要调控作用,为大蒜NAC蛋白的生理调控功能的分析奠定了理论基础.

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