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太湖日本沼虾的遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴滟 1 ; 傅洪拓 1 ; 李家乐 2 ; 龚永生 1 ; 李明爽 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

2.上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室

3.南京农业大学无锡渔业学院

关键词: 日本沼虾;太湖水域;遗传多样性;RAPD分析

期刊名称: 上海水产大学学报

ISSN: 1004-7271

年卷期: 2008 年 17 卷 05 期

页码: 620-624

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对太湖湖区不同水域(无锡、宜兴、苏州及湖州水域)野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp~2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49.57%、60.68%、53.85%、57.26%,杂合度为0.2077~0.2163,Shannon信息指数为0.2967~0.3053,群体间遗传分化指数Gst值为0.1644~0..2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16.67%是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大(0.1481),无锡与宜兴群体间遗传距离最小(0.1141)。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。

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