文献类型： 中文期刊

作者： 聂志娟 ¹ ; 徐钢春 ² ; 邵乃麟 ² ; 王保战 ¹ ; 高建操 ² ; 徐跑 ² ; 何健 ¹ ;

作者机构： 1.南京农业大学生命科学学院

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词： 哈尼梯田;稻-鲤综合种养;菌群结构;肠道;高通量测序

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2022 年 62 卷 004 期

页码： 1473-1484

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征.[方法]通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异.[结果]梯田稻鲤组(RCIC)、传统池鲤组(YPIC)和水泥池鲤组(HPIC)分别获得了2 345、238和118个OTU.RCIC组的Sobs指数及PD指数最高,显著高于YPIC组(P<0.05),极其显著高于HPIC组(P<0.01);池塘单养模式下,两组之间多样性指数也存在显著差异,YPIC组大于HPIC组(P<0.05).含量大于10%优势菌门:RCIC组主要为变形菌门(39.39%)、梭杆菌门(38.55%)和厚壁菌门(15.4%);YPIC组为变形菌门(21.87%)、梭杆菌门(58.27%);HPIC组为变形菌门(46.63%)、梭杆菌门(53.14%).变形菌和梭杆菌为3组福瑞鲤肠道样品的优势菌群,其中的鲸杆菌属(Cetobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)为核心优势菌属.LEfSe线性判别分析(LDA>3)显示17个具有差异的标记菌属,其中Romboutsia、Clostridium_sensu_stricto_1、Enterobacter、Paraclostridium、Methylobacterium、norank_f_norank_o_Chloroplast、Edwardsiella、Epulopiscium为RCIC组具有的差异标记菌属.[结论]不同养殖模式的福瑞鲤既有固有菌群,也塑造差异显著的肠道菌群组成结构.稻梯田鲤肠道菌群丰富度和多样性显著增加,且具有更多的有益差异标记菌属,获得更健康的肠道菌群群落特征.