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PAM细胞中猪MMP14不同转录本检测及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴俊静 1 ; 万绪玲 2 ; 黄藏宇 1 ; 乔木 1 ; 武华玉 1 ; 梅书棋 1 ; 彭先文 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

2.江夏区动物卫生监督所

关键词: 猪;MMP14;不同转录本;PRRSV

期刊名称: 湖北农业科学

ISSN: 0439-8114

年卷期: 2020 年 023 期

页码:

收录情况: 北大核心

摘要: 基质金属蛋白酶14(MMP14)是基质金属蛋白酶家族中首个被发现的膜型基质金属蛋白酶.MMP14蛋白能水解多种细胞外基质组分和血清蛋白,促进细胞外基质降解,并可水解细胞因子、趋化因子和生长因子等.研究发现猪肺泡巨噬细胞(PAM)中存在2种猪MMP14转录本,利用荧光定量PCR技术检测了PRRSV感染的猪PAM细胞中猪MMP14基因不同转录本的表达水平变化,发现PRRSV感染后导致转录本NM214239.2显著下调表达(P<0.05),而转录本XM021098303.1极显著上调表达(P<0.01).通过生物信息学分析发现,2种转录本编码的蛋白前肽区序列存在明显差异.XM021098303.1编码的蛋白比NM214239.2编码的蛋白序缺少了RRKR基序和PGbinding1功能区,可能导致MMP14蛋白不具有功能活性.推测PRRSV感染后抑制MMP14活性,与PRRSV刺激细胞因子与趋化因子的大量表达相关.然而,MMP14在PRRSV感染中的具体作用还有待进一步研究.

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