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小麦LBD基因家族的全基因组鉴定、表达特性及调控网络分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邢光伟 1 ; 王梦醒 2 ; 马小飞 2 ; 赵贤 2 ; 张婷 2 ; 聂小军 2 ; 宋卫宁 3 ;

作者机构: 1.西北农林科技大学农学院;山西省农业科学院小麦研究所

2.;西北农林科技大学农学院;山西省农业科学院小麦研究所

3.;西北农林科技大学农学院;山西省农业科学院小麦研究所;

关键词: 小麦;LBD基因家族;逆境胁迫;共表达网络;表达谱

期刊名称: 麦类作物学报

ISSN: 1009-1041

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 855-863

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为深入发掘小麦LBD基因的功能,利用小麦最新基因组数据,通过生物信息学手段,对小麦LBD基因家族进行了鉴定,并对其表达特性及调控网络进行了分析。鉴定结果表明,本研究得到了75个小麦LBD基因,根据系统进化分析结果,可将它们划分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族。染色体定位结果表明,除了5D和7D外,其余染色体均含有LBD基因。共表达调控网络分析表明,15个LBD基因参与了小麦功能基因调控。利用RNA-seq数据对所有小麦LBD基因在不同组织以及不同逆境胁迫下的表达情况进行分析表明,小麦LBD基因在不同组织间和胁迫下存在着差异表达,多个组织特异和胁迫响应相关LBD基因被鉴定到,可作为后续功能研究的候选基因。

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