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岩牡蛎正常和低盐胁迫下定量PCR内参基因的筛选与验证

文献类型: 中文期刊

作者: 宫建文 1 ; 李琪 1 ; 于红 1 ;

作者机构: 1.中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

关键词: 岩牡蛎;实时定量PCR;内参基因;低盐胁迫

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2019 年 04 期

页码: 657-663

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 实时荧光定量PCR已广泛用于基因表达的分析,合适的内参基因选择是获得准确分析结果的关键。本研究选用正常生理状态下岩牡蛎(Crassostreanippona)的鳃、外套膜、闭壳肌和内脏团4种组织以及盐度10、20和30暂养1周后的鳃组织为材料,对已报道的常见内参基因(EF1A、GAPDH、RO21、TUB和TUA)的稳定性通过3种方法(geNorm、NormFinder和BestKeeper)进行分析和筛选,发现针对鳃单一组织在不同盐度胁迫下,GAPDH和RO21可以作为合适内参基因,而在不同组织中,需要更多的内参基因联合分析才能获得准确的定量表达结果。本研究是首次利用q-PCR对岩牡蛎进行内参基因的筛选和验证,为今后该物种低盐胁迫相关的基因表达和功能基因的研究提供重要依据。

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