您好,欢迎访问湖北省农业科学院 机构知识库!

桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘勇 1 ; 王富荣 1 ; 王会良 1 ; 艾小艳 1 ; 朱炜 1 ; 孙中海 1 ; 吕亮 2 ; 龚林忠 1 ; 何华平 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院

2.湖北省农业科学院植物保护与土壤肥力研究所

关键词: 桃;流胶病;葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea);转录组测序;差异表达基因

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2024 年 006 期

页码: 1842-1849

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探讨桃响应葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)侵染的分子机制,本研究以‘丰光’油桃作为研究材料,采用高通量测序技术对被B. dothidea侵染的桃枝干组织进行转录组测序,共筛选到1 463个差异表达基因(DEGs),其中上调911个,下调552个。差异表达基因注释到GO、KEGG数据库中的数目分别为1 231、255。GO功能分类结果显示DEGs主要富集在细胞组成、分子功能和生物学过程三个方面。细胞组成主要包括细胞组分、细胞、细胞器、膜等;分子功能主要集中于催化活性、核酸结合转录因子活性、转运活性、受体活性等;生物学过程主要富集在细胞过程、代谢过程、应激反应、生物调节等。KEGG分析结果表明差异表达基因涉及66个代谢途径,且主要富集在植物与病原互作、植物激素信号转导代谢通路。大量与植物抗病性、乙烯信号途径、钙信号途径相关的基因被B. dothidea侵染所激发。随机选取16个基因进行RT-qPCR定量分析,发现RT-qPCR结果与转录组测序结果趋势一致。本研究结果明确了桃响应B. dothidea侵染过程中相关基因的表达情况,为深入研究病原物的致病机理提供参考依据。

  • 相关文献

[1]桃流胶病在湖北省发生的影响因子分析. 刘勇,龚林忠,王富荣,王会良,艾小艳,何华平,王泽琼. 2018

[2]桃流胶病在湖北省发生的影响因子分析. 刘勇,龚林忠,王富荣,王会良,艾小艳,何华平,王泽琼. 2018

[3]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[4]湖北省桃流胶病发生情况的调查. 刘勇,王富荣,王会良,顾霞,诸小敏,龚林忠,何华平. 2013

[5]湖北'天仙红'桃树流胶病病原菌鉴定. 刘勇,龚林忠,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,张杨,何华平. 2023

[6]禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平. 2018

[7]基于盐胁迫转录组信息的蚕豆F-box基因家族分析. 郝树琳,陈宏伟,廖芳丽,李莉,刘昌燕,刘良军,万正煌,沙爱华. 2020

[8]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019

[9]禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析. 孔令严,罗青平,卢琴,邵华斌,李槿年. 2017

[10]80份绿豆象抗感蚕豆种质资源SSR遗传多样性分析. 孙虎,刘昌燕,李莉,刘良军,韩雪松,万正煌,沙爱华,陈宏伟. 2023

[11]禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析. 孔令严,汪最,邵华斌,张腾飞,卢琴,罗青平. 2019

[12]高低产蛋鸡产蛋后期卵巢组织差异表达基因筛选及其功能分析. 陈林,王家乡,吴艳,皮劲松,蒲跃进. 2024

[13]桃生长发育过程中果肉、果皮及叶片色素含量的变化研究. 龚林忠,王富荣,何华平,刘勇,王会良,艾小艳. 2015

[14]三种桃果实中的儿茶素、表儿茶素含量比较. 吴飞飞,张笛,周静,王富荣,何华平,徐凌云. 2019

[15]5个桃砧木品种对淹水胁迫的生理响应及耐涝性评价. 朱炜,龚林忠,王富荣,王会良,刘勇,艾小艳,张杨,郎鹏,史文琦,何华平. 2022

[16]不同化学疏花剂对枣油桃的疏果效应. 艾小艳,王富荣,王会良,刘勇,王冲,黎兰献,朱炜,张杨,龚林忠,何华平. 2023

[17]2015年湖北省桃种植业的产销分析. 何华平,王富荣,段毅. 2016

[18]10份湖北地方红肉桃资源生物学特性观察. 龚林忠,何华平,王富荣,顾霞. 2008

[19]丁硫克百威在桃果实上残留的消解动态. A.Barbaal,朱文达. 1997

[20]湖北省桃园害虫发生特点及防控策略. 刘勇,何华平,龚林忠,王富荣,王会良,艾小艳,刘模发,王泽琼. 2016

作者其他论文 更多>>