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山桐子SRAP-PCR反应体系的优化及有效引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 严莉 1 ; 仝铸 2 ; 苏春莉 1 ; 何秀娟 2 ; 肖翠 2 ; 王泽琼 2 ; 周明芹 1 ; 袁龙义 1 ; 邱文明 2 ; 孙中海 2 ;

作者机构: 1.长江大学园艺园林学院

2.湖北省农业科学院果树茶叶研究所湖北省农业科技创新中心果树茶叶研究分中心

关键词: 山桐子;SRAP-PCR;引物筛选;体系优化

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2025 年 23 卷 016 期

页码: 5388-5394

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立适用于山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)的SRAP-PCR反应体系,用于山桐子资源分析和鉴定,本研究以山桐子幼嫩叶片DNA为材料,采用L16(4~5)正交试验设计,对影响山桐子SRAP-PCR反应体系的主要影响因素Mg2+、d NTPs和引物浓度以及Taq DNA聚合酶和模板DNA用量进行优化。结果表明:山桐子SRAP-PCR最优反应体系中模板DNA为30ng、Taq DNA聚合酶用量为1.5U、dNTPs浓度为0.25mmol/L、引物浓度为0.5μmol/L、Mg2+浓度为3 mmol/L、1×PCR buffer,总体系20μL。各因素对山桐子SRAP-PCR扩增效果影响从大到小依次为:Taq DNA聚合酶用量、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度。采用优化后的体系对267组SRAP引物进行筛选,其中220对引物组合可扩增出目的条带(引物有效性82.39%);157对引物组合能够扩增出清晰且多态性较高的条带。利用其中6对引物组合对24份山桐子资源进行了遗传分析,聚类结果客观反映了这些资源的地理分布和亲缘关系。以上结果表明本研究优化的山桐子SRAP-PCR反应体系稳定、可靠,可用于山桐子遗传资源研究等应用。

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