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柑橘黄龙病菌亚洲种分子检测引物评价及绝对定量PCR体系优化

文献类型: 中文期刊

作者: 谢帆 1 ; 龚顺 1 ; 王泽琼 1 ; 肖玉雄 1 ; 杜志强 2 ; 仝铸 1 ; 何秀娟 1 ; 邱文明 1 ; 孙中海 1 ; 潘志勇 3 ; 肖翠 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

2.宜昌三峡百景宜农业科技发展有限公司

3.华中农业大学园艺林学学院

关键词: 柑橘黄龙病;常规PCR;巢式PCR;绝对定量PCR;引物评价

期刊名称: 植物保护

ISSN: 0529-1542

年卷期: 2024 年 003 期

页码: 234-246

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 柑橘黄龙病是对柑橘产业最具毁灭性的病害,目前没有可用的有效药剂和抗病品种,分子检测对黄龙病有效防控至关重要。本研究对国内外常用的常规PCR和巢式PCR检测引物进行评价,针对多拷贝的nrdB和16S rDNA基因,构建质粒标准品并筛选适用于绝对定量PCR的最佳质粒。结果表明,使用Es Taq MasterMix对感染Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas)的柑橘样品进行常规PCR检测时,在评价的16对引物中,OI1/OI2c、Las606/LSS和HLBF468/R877灵敏度最高,推荐同时使用检测黄龙病菌含量低的样品;各组巢式PCR检测引物有其适用扩增体系,部分引物用Es Taq MasterMix扩增时出现非特异性扩增,F1/B1→F3/B3则适用Es Taq MasterMix体系,且最高可稳定特异检出10~5倍稀释感染CLas柑橘总DNA样品(2×10-3 ng/μL),是灵敏度最高的引物组,OI1/OI2c→S3/S4在Es Taq MasterMix和Ex Taq DNA聚合酶体系中均可稳定特异检出10~4倍稀释感染CLas柑橘总DNA样品(2×10-2 ng/μL),是适用扩增体系最广的引物组;构建的5个绝对定量PCR质粒标准品中,pnrdB83扩增效率最接近100%,且在2次重复试验中波动最小,稳定性最强,并且作为标准品对黄龙病待测样品进行绝对定量时,各样品在2次重复试验中的拷贝数差值最小,是本研究筛选的最佳质粒。本研究的结果将为柑橘黄龙病菌的定性和定量分子检测提供参考。

  • 相关文献

[1]应用巢式PCR法检测猪单个胚胎中的基因突变. 任红艳,肖红卫,李晓敏,徐振宇,毕延震,华再东,郑新民. 2016

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