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新疆地区犊牛冠状病毒的病原调查及S基因的遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 贾开文 1 ; 操义恒 1 ; 胡亚辉 1 ; 党士荣 1 ; 钟发钢 1 ; 赵文娟 1 ; 吴桐忠 1 ; 韩猛立 1 ; 张星星 1 ; 张倩 1 ; 周霞 2 ; 黄新 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

2.石河子大学动物科技学院

关键词: 牛冠状病毒;流行病学调查;S基因;遗传进化分析

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 664-669

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采集了新疆8个地区15个牛场421份4月龄内犊牛的肛拭子,应用RT-PCR方法扩增牛冠状病毒(bovine coronavirus, BCoV)N基因和S基因,对S基因蛋白序列进行遗传进化分析。结果显示,BCoV个体核酸阳性率为19.91%(67/421),7~30日龄犊牛阳性率为33.59%(44/131),有临床腹泻症状犊牛的核酸阳性率为18.21%(57/313),伊犁地区最高34.88%(15/43);获得3条S基因序列,全长分别为4 092、4 092、4 093 bp,与参考序列核苷酸同源性为98.88%~99.46%;遗传进化分析显示3条S基因与国内四川毒株SWUN/NMG-13(MW711304.1)和BCOV-China/SWUN/LN4(MK095182.1)核苷酸同源性最近,为99.3%~99.4%,均属于GⅡ型;与国内外17株参考毒株相比,所测毒株存在23个氨基酸位点突变,均在I113V、D115A、S501P和T510S位点出现突变。结果表明,新疆地区1~4月龄犊牛普遍存在BCoV感染,且S蛋白存在部分突变。本研究揭示了新疆牛场犊牛BCoV不同月龄和地域流行分布及其S蛋白的变异特征,为BCoV防制提供了依据。

  • 相关文献

[1]新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析. 黄新,吴桐忠,韩猛立,张星星,何延华,钟发刚. 2019

[2]一起羊附红细胞体病流行病学调查治疗报告. 范坤江,何立雄,张元静,邱国斌,李胜,张星星,韩猛立,杨浩可,陈朝阳,吾山,陈新华. 2020

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